四川大学华西医院是中国西部疑难危急重症诊疗的国家级中心，医疗水平处于全国先进行列。

华西医院是中国重要的医学科学研究和技术创新的国家级基地。医院现有国家重点实验室1个，部级重点实验室2个，中心开放实验室43个；设有中国循证医学中心，国家新药、中药安全性评价中心（GLP），国家药品临床研究基地（西药和中药GCP），国家新药药效评价中心，国家化妆品安全性和功效性检验机构等。近五年来，获得国家自然科学基金、科技重大专项、973、863、科技支撑、公益性行业科研专项、等国家计划项目700余项，年均科研项目经费上亿元。近五年来获各级政府科技奖80余项；申请专利600余项，已获专利授权400余项；发表科技论文在全国医疗机构中名列前茅，其中被SCI和MEDLINE收录及表现不俗科技论文数量连续多年名列全国第一。